La comunidad de navajos rescata a un moribundo Mulder y le somete a un ritual de sanación que sitúa al agente entre dos mundos. Mientras, Scully se enfrenta a las consecuencias de las acciones de ambos y es suspendida del servicio. La cinta DAT ha desaparecido...
Con la fotografía de su padre y la ayuda de "El Tirador Solitario", los agentes logran localizar a un antiguo criminal de guerra nazi, implicado en una operación gubernamental secreta. Este les dirige a una mina de Virginia, donde se oculta buena parte de los secretos del Plan Maestro.
La investigacion de Jeremiah, un sereno individuo que hace sanar heridas mortales simplemente tocandolas con su mano es bruscamente interrumpida cuando Mulder recibe la noticia que su madre ha sido hospitalizada. Seguidamente X le entrega a Mulder fotos de su madre discutiendo con el fumador y le informa que se conocian hacia tiempo. La aparicion del alienigena asesino y de varias personas identicas y del mismo nombre que el misterioso sanador hace que todos los acontecimientos se relacionen peligrosamente.