De todas formas las primeras oleadas violentas de la invasión asiáticas coincidieron con el tiempo de desintegración del país y debilidad de los faraones. Destruyeron ciudades, derribaron templos y profanaron tumbas y altares, y nombraron a un jefe suyo, llamado Salites como faraón que gobernó el país desde Manfis. En realidad, el triunfo de los Hyksos sobre los egipcios se debió a varias razones fundamentales, entre ellas:
-Los Hyksos llegaron montados sobre los caballos, mientras el egipcio desconocía su existencia.!
-Los Hyksos armamento de hierro, mientras el armamento de los egipcios era de bronce.
Poco a poco, los reyes Hyksos, iban adquiriendo las costumbres egipcias y adoraron a los dioses egipcios, sobre todo el dios Sotekh o Seth, pero los monarcas, príncipes y el pueblo egipcio, se resistió a a aceptar su gobierno y como ya es habitual en la historia del Egipto Antiguo, se organizó la resistencia y la guerra de la reunificación desde el sur. La guerra de la liberación
Conocemos de un papiro de la dinastía XIX, que el rey de los Hyksos, Abuphis, provocó al gobernador egipcio de Thebes, Sequenen Ra II, enviándole una misiva en la cual le pedía que acallara el ruido que causaban los hipopotámos en Tehebes, porque este ruido no le dejaba dormir en Menphis. Por las heridas que se observan en La Momia de Sequenen Ra II, sabemos que murió en la guerra luchando contra los Hyksos. Su hijo Kames continuó la lucha y atacó a los Hyksos en El Medio Egipto y venció a Abuphis, aunque Egipto no se quedó liberado del Todo hasta el reinado de su Hermano Ahmose I quien persiguió a los Hyksos hasta Palestina.